Egyszerűsíti a glikán heterogenitás elemzését az egyes glikozilációs helyeken
Az N-kötött glikánok elemzését leggyakrabban úgy végzik, hogy először leválasztják a glikánt a fehérjéről. Bár ez a megközelítés mind mennyiségi, mind minőségi szempontból pontos, a kapott eredmény az összes lehetséges glikoproteinből és glikozilációs helyről származó glikánok átlagolt képe. Annak érdekében, hogy a glikánok heterogenitására összpontosíthassunk, amely egy adott, érdeklődésre számot tartó glikozilációs helyen fordul elő, az elemzést glikopeptid szinten kell elvégezni enzimatikus fehérjeemésztések segítségével. Mivel azonban a glikopeptidek egyedi tömeggel rendelkeznek, az adatelemzés munkaigényes informatikát és manuális adatfeldolgozást igényel. Az Erexim™ Application Suite-ot úgy tervezték, hogy megkönnyítse a helyspecifikus glikán heterogenitás elemzését azáltal, hogy testreszabható, azonnal használható módszereket és automatizált adatelemzést biztosít.
- Minden glikánszerkezetet támogat egy testreszabható adatbázis segítségével.
- Minimális felhasználói bemenettel generált MRM módszerfájl
- Kvantitatív és kvalitatív eredmények vizualizálása

Mi az Erexim™ (energiafelbontású oxóniumion-monitorozás)?
A glikánok vagy glikántartalmú molekulák MS/MS-sel történő elemzésekor a fragmentáció során keletkező termékionok nagy mennyiségben tartalmaznak glikánból származó alacsony m/z-értékű ionokat, az úgynevezett oxóniumionokat. Bár az oxóniumionok faja és relatív gyakorisága tükrözi a glikán eredetű szerkezetet, a hagyományos MS/MS nem nyújt elegendő jellemzőt a glikánszerkezetek megkülönböztetéséhez. Az energiafelbontású oxóniumion-monitorozás, rövidítve Erexim™, az MS/MS-adatokhoz egy újabb dimenziót ad hozzá azáltal, hogy a fragmentáció ütközési energiáinak (CE) sorozatában gyűjt adatokat. Az oxóniumionok abundanciájának a CE függvényében bekövetkező változásának ábrázolása, az Erexim™ profil, most már tartalmazza a hasonló glikánszerkezetek megkülönböztetéséhez szükséges felbontóképességet. Az Erexim™ háromszoros kvadrupólus tömegspektrometriát igényel az adatpontok sokaságának megszerzéséhez, valamint ultragyors pásztázási sebességet és a reprodukálható profilok megszerzéséhez, ezenkívül az Erexim™ által megcélzott termékionok egyike specifikus az N-glikán magszerkezet, és ideális riporterion a glikánszerkezetek relatív mennyiségi meghatározásához.

Testreszabható glikánszerkezeti adatbázis - Profil adatbázis-kezelő
Az Erexim™ Application Suite adatbázisa 45 N-glikán szerkezetű bejegyzést tartalmaz. Minden egyes bejegyzés tartalmazza a monoszacharid-összetételt, a kapcsolódási információkat, az aminosav-szekvenciát (ha glikopeptid) és a referencia Erexim™-profilt. A bejegyzéseket az ügyfelek bővíthetik, hogy naprakészek maradjanak a kutatás előrehaladásával.

A bemeneti adatok összeállítása "redy-to-use" módszerré - MRM Method Maker
Részletes mennyiségi elemzéshez, valamint az Erexim™ profil adatgyűjtéséhez az MRM-átmenetek száma több száz is lehet, és rendkívül munkaigényes ezek helyes megtervezése. Az MRM Method Maker automatikusan létrehozza az MRM-átmeneteket az érdeklődésre számot tartó glikánszerkezetek, a peptidszekvencia, az ionaddukt típusa és egyéb bemeneti adatok kiválasztása alapján. Az olyan MS  paraméterek, mint a CE, a tartózkodási idő stb. szintén kollektíven rendelhetők hozzá.

Az adatok automatizált grafikus megjelenítése - Data Analyzer
Mivel a glikánok és glikopeptidek több töltésállapotban detektálhatók az LC/MS-ben, meghatározásuk komplex adatmanipulációt igényel az egyes molekuláris fajokból származó összes ion helyes kombinálásához. Ezt a folyamatot a Data Analyzer automatizálja, és az eredményt grafikusan mutatja be, akár a relatív abundancia oszlopdiagramjaként, akár Erexim™ profil ábraként.