Traverse-MS

A Traverse MS adatelemző szoftver a Shimadzu hármas kvadrupól LCMS-rendszerekkel szerzett MRM-adatok nagy sebességű feldolgozására szolgál a célzott metabolomika területén. Több minta és több komponens felhasználásával a szoftver képes grafikus és statisztikai elemzést készíteni a metabolikus útvonalak elemzéséhez.
Megjegyzés: A szoftver a Reifycs Inc. terméke.

Több kromatogram megjelenítése egyetlen ablakban
Egyetlen mintából vagy több mintából származó több komponens kromatogramjai egymás mellett is megjeleníthetők. Az egymás mellett funkció lehetővé teszi az adatok jobb vizualizálását, megkönnyítve a csúcsok azonosítását. Ennek a felhasználói felületnek az egyedi jellemzői hatékony folyamatot biztosítanak a csúcsok azonosításához több komponens esetében.

MRM-adatokra specializált csúcsazonosító algoritmus
Az MRM-adatokra specializált csúcsazonosító algoritmus nagy sebességgel dolgozza fel a több mintára és több komponensre vonatkozó adatokat. Az algoritmus a célkomponensek csúcsaihoz pontszámokat rendel a megadott referenciacsúcsokhoz való hasonlóságuk alapján.

Területértékek (és területarányok) grafikus ábrázolása több mintára vonatkozóan
Az MRM-adatokban lévő csúcsok azonosítása után a szoftver grafikusan ábrázolja az egyes komponensek csúcsterület-értékeit vagy a belső standard anyagok csúcsterület-arányértékeit. A minták csoportokra történő szétválasztásával a célkomponensek átlagos területértékei és standard eltérési értékei grafikusan ábrázolhatók a több csoport közötti összehasonlítás érdekében. Az átfogó analitikai adatok ilyen módon történő grafikus ábrázolása lehetővé teszi a felhasználók számára az analitikai eredmények intuitívabb megértését.

A főkomponens-elemzésen és hierarchikus klaszterelemzésen alapuló statisztikai elemzés
A több mintából és több komponensből származó MRM-adatok statisztikai elemzési technikákkal, például főkomponens-elemzéssel és hierarchikus klaszterelemzéssel elemezhetők. A nagy mennyiségű MRM-adatok egyenkénti elemzése rendkívül időigényes lehet, a statisztikai elemzési technikák azonban vizuális és könnyen érthető analitikai eredményeket biztosítanak a felhasználók számára.

Támogatja a metabolikus útvonalak elemzését
A biológiai organizmusok anyagcsere-ingadozásainak megértéséhez fontos megérteni a célkomponensekhez kapcsolódó anyagcsere-útvonalak mentén bekövetkező anyagcsere-ingadozásokat. Ez a szoftver tartalmazza a glikolitikus rendszerek, a pentóz-foszfát és az aminosavszintézis útvonalainak alapvető anyagcsere-térképeit, amelyek betölthetők a reprezentatív anyagcsere-utak megjelenítéséhez. Az egyes metabolitok grafikusan ábrázolt ingadozásainak összekapcsolásával metabolikus útvonalelemzés érhető el.

Több kromatogram egyidejű megjelenítése az MRM Outlook funkció segítségével

Az MRM Outlook funkció használható a detektált csúcsok megerősítésére és a szükséges korrekciók elvégzésére az összes mintából származó kromatogramoknak az egyes metabolitok referencia-kromatogramjával való összevetésével.
A hagyományos módszereknél minden egyes minta kromatogramját egyenként kellett vizuálisan ellenőrizni, ami nem hatékony. Az MRM-adatokra specializált automatikus azonosítási algoritmus és az MRM Outlook funkció azonban jelentősen csökkenti a munkát és növeli a hatékonyságot.

Grafikonok létrehozása adatmátrixból

A Data Matrix képes az adatokat "osztályokba" sorolni és az értékek alapján normalizálni. Az egyes csúcsok magasságát és területét az egyes célkomponensek kromatogramjaiból határozza meg. Ezen értékek alapján a szoftver oszlopdiagramokat jelenít meg az osztályok magasság- vagy területértékének átlagáról és szórásáról. Ezek a hisztogramok lehetővé teszik a felhasználók számára az adatok egyszerű megtekintését.

Metabolikus útvonal-elemzés

A szoftver egy sablon metabolikus térképfájl betöltésével vagy egy új metabolikus térképfájl létrehozásával reprezentatív anyagcsere-útvonalakat jelenít meg.
Az adatmátrixból létrehozott vegyületgrafikonok összekapcsolhatók metabolikus útvonalak létrehozásához, így a felhasználók részletesebben megérthetik az érdeklődésre számot tartó vegyület-metabolitok ingadozását.

Megjegyzések és óvintézkedések
1. Kizárólag kutatási célú felhasználásra. Nem használható diagnosztikai eljárásokban.
2. A Shimadzu nem vállal garanciát az adatbázisban szereplő információk pontosságára vagy az adatbázis használatával nyert információk hasznosságára vonatkozóan.

Érdeklődés a termék iránt

5 + 8 =

You may also like…

Ne maradjon le új anyagainkról, iratkozzon fel hírlevelünkre!